SASA计算
想用amber算轨迹的溶剂可及性表面积SASA，可是不知道该怎么做，看amber教程也没找到，请各位前辈指教 amber 教程里是没有的，要用到cpptraj, 输入文件是***.ptraj,内容比如下边：trajin ./prod1.mdcrd
molsurfprotein:1-233out surf probe 1.4
molsurfligand :234 out surf probe 1.4
molsurfcomplex:1-234out surf probe 1.4
命令行输入：cpptraj ***.prmtop < ***.ptraj
输出文件在 surf 中，
这么久了，估计楼主问题已解决了吧
:)
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