韩小寒qqq 发表于 2015-7-4 21:29:23

使用autodock将蛋白质受体与小分子配体分开

怎样使用autodock将蛋白质受体与小分子配体分开

川大-灰太狼 发表于 2015-7-4 21:53:51

autodock本身只能做分子对接，建议使用pymol，chimera，vmd来可视化分离配体和蛋白，当然也可以直接编辑pdb文件来分离配体和蛋白。

princewangzijie 发表于 2015-7-7 09:23:50

autodock也可以做到的你选中小分子 删除就可以啦 在保存为相应的pdb格式 就可以了 或者你可以直接修改pdb源代码 就行了就可以吧蛋白和小分子分开了

韩小寒qqq 发表于 2015-8-21 16:22:01

princewangzijie 发表于 2015-7-7 09:23
autodock也可以做到的你选中小分子 删除就可以啦 在保存为相应的pdb格式 就可以了 或者你可以直接修改p ...

嗯，用autodock分开了，谢谢回复:)
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