hongyibaixue 发表于 2015-3-26 16:50:35

关于g_energy

对MD结果分析，g_energy -f md.edr -s md.tpr -o Potential.xvg -b 15001 -e 40000，然后选择Potential，在终端界面立刻输出结果为
Energy                      Average         Err.Est.       RMSD       Tot-Drift
-----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Potential                -2.5766e+06         27          1626.5      -103.772(kJ/mol)

我想问一下，Average、Err.Est、RMSD、Tot-Drift分别是什么意思？尤其是Tot-Drift代表什么意思，好像都是用这个值来作图的，但为什么输出的-o Potential.xvg中只有一列Average的值，根本就没有Tot-Drift的任何信息？

邓健 发表于 2015-3-28 13:46:06

建议楼主看手册，上面写的很清楚。

zhangmao511 发表于 2015-3-30 19:52:35

同问，手册你指的是manual吗？？翻了半天没看到啊？？搜Err.Est.也搜不到，Tot-Drift也没搜到。
请问，在哪一章呢？

zhangmao511 发表于 2015-3-30 19:52:58

邓健 发表于 2015-3-28 13:46
建议楼主看手册，上面写的很清楚。

同问，手册你指的是manual吗？？翻了半天没看到啊？？搜Err.Est.也搜不到，Tot-Drift也没搜到。
请问，在哪一章呢？

邓健 发表于 2015-3-31 14:42:18

zhangmao511 发表于 2015-3-30 19:52
同问，手册你指的是manual吗？？翻了半天没看到啊？？搜Err.Est.也搜不到，Tot-Drift也没搜到。
请问，在 ...

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