背包旅客 发表于 2015-3-24 21:04:10

autodock运行docking程序时一直无法完成运行

    本人刚开始学autodock，熟悉了软件之后是按着教程一步一步做1HSG的例子，先grid再dock的，前面所有操作跟教程一模一样，grid也能正常运行，但是到运行dock的时候，运行了几个小时一直没有运行完成。后来索性强制关了界面，查看dock的记录日志ind.dlg文件，发现显示错误：eval.cc:ERROR!energy is infinite!（能量无穷大）
    我按着教程重做了三遍，还是出现同样的错误！{:soso_e127:}

eval.cc:ERROR!energy is infinite!（能量无穷大）   
    跪求大神帮忙解决问题！！！O(∩_∩)O谢谢



墨竹晓风 发表于 2015-3-26 14:12:52

首先将dimensions设定为50，50，50试试。如果还是错误的话，检查下蛋白质是否完整，原子间crash等问题。

背包旅客 发表于 2015-3-27 11:19:54

墨竹晓风 发表于 2015-3-26 14:12
首先将dimensions设定为50，50，50试试。如果还是错误的话，检查下蛋白质是否完整，原子间crash等问题。 ...

调整了grid的尺寸，果然很顺利解决了问题！O(∩_∩)O谢谢大神指点！:lol:lol

墨竹晓风 发表于 2015-3-30 17:08:38

背包旅客 发表于 2015-3-27 11:19
调整了grid的尺寸，果然很顺利解决了问题！O(∩_∩)O谢谢大神指点！

不客气，加油！
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