zhangmao511 发表于 2015-2-8 21:24:12

请教Gromacs的压力耦合参数设置的一个问题,谢谢!

在Gromacs里压力耦合参数里有一个参数refcoord-scaling,想问一下将refcoord-scaling参数设置成com和all,模拟结果有什么区别吗?
我的体系是一个膜蛋白的体系,以这个体系为例,这2个参数设置不同的实质区别在哪呢?
Note:我已经看过GMX手册上关于refcoord-scaling的解释,还是有点不太懂,难道差别只是“The vectors of each reference coordinate to the center of mass are not scaled”吗??
在这里请教了,谢谢各位大侠的指点,希望能得到一些经验解释,感谢!!
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