light 发表于 2014-11-27 22:00:32

【致谢飞天大神及各位坛友】ubuntu、gromacs、g_mmpbsa的安装

本帖最后由 light 于 2014-12-2 13:14 编辑

ubuntu安装：
http://www.ubuntu.com/download/
免费得Linux系统。下载的时候选折alternative download用种子下载会下载的很快
http://jingyan.baidu.com/article/ff42efa9423991c19e22020d.html
系统安装教程。做个启动盘，全程无脑安装，最好在联网情况下进行。
系统的安装不会出什么问题，全程应该都很顺利。

gromacs的安装：
在ubuntu下，连接互联网。
sudo apt-get install gcc
sudo apt-get install g++
sudo apt-get install gfortran
sudo apt-get install cmake
sudo apt-get install gromacs
过程中提示你缺什么就装什么，全程无脑安装。
自动安装出来的是4.6.5的版本，单精度并行版。

g_mmpbsa的安装：
现在根本不用编译了
http://rashmikumari.github.io/g_ ... d-Installation.html
按照说明下载相应地版本，直接复制粘贴就好了。再也不用担心装不上的问题。
无脑安装。


谨以此贴感谢飞天大神和群里的朋友们给予我的无私帮助，并献给以后和我一样的初学者们，祝愿你们能少走弯路！

light 发表于 2014-12-7 20:20:59

zhangmao511 发表于 2014-12-6 00:25
问一下，g_mmpbsa现在是不是只支持gromacs4.6.X的版本啊？？5.0以上的版本不支持吗？？ ...

http://rashmikumari.github.io/g_mmpbsa/
Supports GROMACS 4.5.x and 4.6.x versions.
官网上是这样写得。
至于5.0能不能用我也不知道啊，你可以装了试试，也不麻烦。

light 发表于 2015-9-24 21:47:05

kangsgo 发表于 2015-8-3 13:34
请问一下这样装下来默认是装在哪里了呀？

额，我也不知道装哪了，不过能用就可以了啊

数据挖掘 发表于 2018-3-30 09:28:58

kangsgo 发表于 2015-8-3 13:34
请问一下这样装下来默认是装在哪里了呀？

which mdrun

atmdd 发表于 2014-12-1 09:17:16

给力啊，期待MMPBSA分析经验帖

light 发表于 2014-12-1 12:14:58

atmdd 发表于 2014-12-1 09:17
给力啊，期待MMPBSA分析经验帖

做完了一定会发的

zhangmao511 发表于 2014-12-6 00:25:27

问一下，g_mmpbsa现在是不是只支持gromacs4.6.X的版本啊？？5.0以上的版本不支持吗？？

zhangmao511 发表于 2014-12-6 00:25:54

问一下，g_mmpbsa现在是不是只支持gromacs4.6.X的版本啊？？5.0以上的版本不支持吗？？

南华-ET 发表于 2015-1-31 21:53:35

给力，帮了我大忙

zycz138 发表于 2015-7-27 13:58:59

顶一下师弟:lol

kangsgo 发表于 2015-8-3 13:34:38

请问一下这样装下来默认是装在哪里了呀？
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