wzp9012 发表于 2014-10-21 09:57:30

请教,模型B-factor用何种软件计算得到

请教各位前辈，在文献里看到计算模型的软件B-fitter，但下载不了，不知哪位有这款软件。或者对于模型的B-factor还可以利用何种软件分析得到？谢谢！

小不点儿琪琪 发表于 2014-12-11 14:54:56

请问你找到这个软件了吗

dongdawn 发表于 2014-12-16 15:47:12

gromacs可以g_rmsf -f md_noPBC.xtc -s md.tpr -o rmsf-per-residue.xvg -ox average.pdb -oq bfactors.pdb -res

graper2010 发表于 2015-1-19 20:32:35

B-FITTER (http://www.mpi-muelheim.mpg.de/reetz.html).
楼主可以看看这篇文献Iterative saturation mutagenesis (ISM) for rapid
directed evolution of functional enzymes

graper2010 发表于 2015-1-19 20:34:04

晕 楼主提问是去年十月份的了不知道是不是晚了

wzp9012 发表于 2015-3-18 19:06:12

graper2010 发表于 2015-1-19 20:34
晕 楼主提问是去年十月份的了不知道是不是晚了

没事，同样谢谢你！我之前也下了这篇文献，但上面的链接无法打开。所以看看有没有别的下载地址，或哪位仁兄有的。

smileyujun 发表于 2015-4-2 15:56:48

wzp9012 发表于 2015-3-18 19:06
没事，同样谢谢你！我之前也下了这篇文献，但上面的链接无法打开。所以看看有没有别的下载地址，或哪位仁 ...

你打开这个链接了吗？或者还有其它什么方法能计算B-factor?

wzp9012 发表于 2015-4-29 08:55:59

smileyujun 发表于 2015-4-2 15:56
你打开这个链接了吗？或者还有其它什么方法能计算B-factor?

还是打不开，看论坛里说 貌似 Discovery Studio也可以算，

smileyujun 发表于 2015-4-29 09:33:30

wzp9012 发表于 2015-4-29 08:55
还是打不开，看论坛里说 貌似 Discovery Studio也可以算，

可以算:P
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