autodock做ligand-protein对接时出现的系列问题（详细）求解
1.Grid 设盒子时出现如下提示。（在受体PDBQT文件准备时，对受体进行add Kollman charges,受体电荷变为-5.403，而把受体导入grids时，grid提示是否保留之前已经加上的电荷以代替 ADT 自动加上 Gasteiger 电荷点，我点yes之后，计算了一下受体电荷变为-32.156。请问我需要怎么处理?我又对受体进行了add Kollman charges,受体电荷变为-5.403，我就接着后续处理了，请问对么？）如图一点击yes 确定后，如图2显示一屏幕的如图3说含有non-boned atoms，这个怎么解决？ 2.导入大分子时又出现了这个unable to assign HAD type to atom N如图4 3.盒子设置时候，怎么通过受体PDB的一个原子找活性位点的坐标？4.如果知道结合位点可能在两个区域，怎么同时做两个盒子的模拟？5.最小能量在什么范围内，结果是比较准确的呢？如file:///C:\Documents and Settings\Administrator\Application Data\Tencent\QQPinyin\Face\ImageCache\20.gif图5 6.点clustering的时候,切换构形时出现这个错误。 如图6 7.最后Analysis- docking- show interaction出错如图7和下面这个，请问该怎么处理？如图8。你的第一个问题我也总遇到，还不会解决，你现在会了吗？ 同求第一个问题
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