dfaqhj 发表于 2014-9-16 09:36:04

autodock活性中心选择残基的问题

在分子对接过程中，已知蛋白质的氨基酸序列和活性中心的位置，怎么确定活性中心的坐标，即box里x,y,z的数值

不经意间的呐喊 发表于 2014-9-16 10:19:01

活性坐标比较简单的选择方式就是配体某个原子的坐标。xyz值就是要包括这个活性口袋。如果有文献参考就更好

浪模拟 发表于 2014-9-20 08:37:36

我觉得这个中心位置的坐标不一定非得那么准确，在set box的窗口中可以通过移动像轮子一样的button（最下方三个）可以移动中心点位置。移到你认为的活性点中心位置就可以读X,Y,Z坐标了。
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