lyn3400189 发表于 2017-6-3 10:21:35

金属酶怎么对接？可以在蛋白PDB文件中改动吗

lyn3400189 发表于 2017-6-3 10:26:28

我的酶PDB结构里含有两个金属离子，其中有铬离子，然后我按照教程去做的时候说要添加铬离子的参数，能帮忙解答一下吗 我还看到论坛有关于金属酶的对接 操作了下没成功

小崔 发表于 2017-11-21 13:46:17

杨梓煜 发表于 2017-1-4 17:29
您好，老师让我做分子对接，我们这没人做个，我想知道我首先需要下载哪几个软件啊？用autodock对接。万分感 ...

哪个学校？

SuperQ 发表于 2018-9-5 21:13:26

shouzhangxin 发表于 2015-1-20 15:08
你好，请教一下在配体 pdb文件产生pdbqt文件时 配体中出现化学键断裂的问题是什么原因？配体pdb文件是从gau ...

你可以试试先做一个能量优化，再导入。比如MM+这类的

xufund 发表于 2018-10-3 07:48:23

学习了。谢谢！

李润泽 发表于 2019-3-26 08:44:09

请问各位大神，两个配体结构相差不大，对接结果类似，但是实际检测的生化活性相差较大。如何评价对接结果与实际生化活性之间的关系？
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查看完整版本: 对接基础问题汇总