蛋白原核表达-密码子优化策略
本帖最后由 浙农林—老张 于 2012-11-28 13:11 编辑 做蛋白原核表达时经常碰到的2个问题是：1、不表达2、包涵体不可溶针对上述情况，除了换载体，宿主细胞，培养基（LB变成TB），增加IPTG浓度等还可以进行密码子优化。需分析下表达的蛋白（如真核多见）同宿主细胞（如E.coli）密码子使用方面是否匹配。如需表达的蛋白中出现稀有密码子，这也会造成不表达等情况出现。解决办法:可分析下蛋白密码子的使用频率。推荐：1 ，下载GCUA
(General Codon Usage Analysis). 1.2 的程序，但是google现在很难找到，试了一些都下载不了。 2.在线分析 http://gcua.schoedl.de/seqoverall.html，可以跟目标宿主菌的密码子偏好性相比，找出哪些密码子是稀有的。QQ截图20121128130924.png(25.67 KB, 下载次数: 0)
2012-11-28 13:10 上传
点击文件名下载附件
static/image/common/rleft.gif
static/image/common/rright.gif
static/image/common/none.gif
static/image/filetype/msoffice.gif
密码子使用频率分析.ppt2012-11-28 12:49 上传
点击文件名下载附件
619.5 KB, 阅读权限: 10, 下载次数: 6
再发一个ppt做补充材料。 老张辛苦了，我想请教下实验的方法怎么确定活性位点？ 这个网站也可以分析稀有密码子，http://www.jcat.de/，呵呵。不过我认为稀有密码子的优化在改善可溶表达方面效果不是很明显
页:
[1]