zhangmao511 发表于 2014-8-18 23:36:47

如何进行2条序列或多序列的建模啊??谢谢

想请教一下大虾,我有2条蛋白序列(我已经知道这2个蛋白相结合成复合体结构),然后我也有它们的模板序列和PDB文件,哪些软件可以对这样的复合体进行建模呢,谢谢!!!SWISS-model尝试了一下,貌似不行,Modeller可以吗??

zhangmao511 发表于 2014-8-26 19:45:33

自己顶一下,Modeller可以吗??

天理-小新 发表于 2014-10-1 16:00:38

如果你的蛋白是同源二聚体,是可以用来建模的,当然dimer也可以的。在建模中要指定距离限制。还有就是,同源建模中无法解决interface interactions。
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