DS2.5 对接后能量计算及保存的问题
我用DS2.5 libdock 做了两个小分子与同个受体之间的对接，想比较一下这两个分子与受体结合能力的强弱，除了打分，还想比较一下小分子-受体之间的能量，如何计算能量?能量越小是不是代表结合的越稳定？我看到文献中用ligplus 软件做对接的二维分子间相互作用，但一直不知道怎么保存对接的结果?找到结果直接输进去ligplus不会出现小分子.
刚开始用论坛，还没有多少金币，:hand::arm:希望好心人帮助！！！
除了对接打分之外，你可以计算小分子和受体之间的结合自由能，能值越低，结合越强。
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