开心果 发表于 2014-7-7 09:55:39

gchen001 发表于 2014-6-3 23:52 static/image/common/back.gif
可能是体系不大适合用PME法算静电相互作用，可以换个方法算静电力试试 shift之类的；或者用1个节点跑会儿， ...

您好 在吗 想问下您做拉伸时是怎样设定拉伸方向的呢我使用俩点的坐标之差确定方向的 但是我不知道用哪个模拟文件中的坐标是npt.gro 还是solv_ions .gro文件中的   如果您懂能指导我下吗 有点急 谢谢哦
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查看完整版本: gromacs拉伸出现错误