有关分子模拟采样点不均的问题
我现在在做的是轮烷在DMSO中穿梭的一组实验。之前做轮烷在水中穿梭的采样点是比较均匀的，不超过两倍的差别。但是现在在DMSO中的采样点居然有几十倍的差不多，让我很费解。好像有采样点不均其结果也不是很可靠的说法。请教各位大侠能不能指点指点，怎么样才能使采样点均匀呢？下面是我的colvar文件设置内容：
colvarsTrajFrequency 5000# output values every 5000 steps
colvarsRestartFrequency2000000
colvar {
name atomDistance
width 0.1
lowerboundary 12.0
upperboundary 15.0
outputSystemForce yes# report also the system force on this colvar
# (in addition to the current value)
lowerwallconstant 40.0
upperwallconstant 40.0
distanceZ {
axis ( 0.0, 0.0, 1.0)
main {
atomNumbers{ 81 85 99 97}
}
ref{
atomNumbers{ 181 202 223 244 265 286 }
}
}
}
abf {
colvars atomDistance
fullSamples 2000
hideJacobian no
applyBias yes
}
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