两个亚基间的夹角计算
大家好！我用amber对一个蛋白进行了MD模拟，这个蛋白有两个亚基组成，在模拟过程中发现这两个亚基发生了相对的旋转。我想问一下：图中的γ角度是如何定义的？最后我想作出这个角度随时间变化的动态图。我试了一下VMD，定义主轴线测量（principal axes），但是好像不对，而且同时给出好几个角度。现在有点迷茫，还望各位能指点一下，谢谢！没人知道吗？文献中是用四元数来定义，图中的轴又是principal axes，搞得有点晕啊！！帖子不能沉啊！ qian430 发表于 2014-1-14 16:51 static/image/common/back.gif
一涉及数学的东西我就蒙，高考才99分。哎
呵呵，数学啊数学，看MD理论的时候我印象最深刻的一个人：汉密尔顿！
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