xd200620940 发表于 2014-1-4 20:34:37

ambertools1.5中用acpype得不到结果的问题

安装了anmbertools1.5和acpype
用acpype做小分子力场参数时,一直没有等到计算结果,几番查找原因
发现ambertools中的sqm不正常。显示如下:

# which sqm
/opt/amber11/AmberTools/bin/sqm
# sqm

Unit    5 Error on OPEN: mdin                                                                                                                                                                                                                                                            

Unit    5 Error on OPEN: mdin   


请各位大大给予帮助,不胜感激!

川大-灰太狼 发表于 2014-1-8 08:57:54

你的环境变量里面设置了 sqm 文件的路径了吗?
可以把你的环境变量设置发上来看看。
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