gromacs 时遇到问题
在做这一步的时候grompp -f em.mdp -c trp_b4em.gro -p trp.top -o trp_em.tpr遇到了问题Fatal error:
moleculetype CU1 is redefined谁遇到了相似的问题能告诉一下都有可能是哪里出现了问题呢 我没有找到
最好能截屏图片上传到论坛里！ 本帖最后由 whl2dxl 于 2014-1-5 13:59 编辑
这个问题 是由于你在 top文件或者 itp文件里面 重复定义了 CU1 这个残基或者分子组。 仔细检查一下 拓扑结构文件吧。
例如：你在 ***.top 里面定义了
CU1 2
同时，你还 include ***.itp文件,而这个itp文件中也有这样一个定义，那么肯定会出现这种问题
谢谢大家热心帮忙 {:soso_e100:} 近几天忙别的东西了 所以没有上论坛来
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