不经意间的呐喊 发表于 2014-1-2 11:15:25

gromacs金属离子处理

在做gromacs的时候，遇到金属离子和配体形成配位作用，请大家指教如何对金属离子CA处理？

川大-灰太狼 发表于 2014-1-2 22:48:10

不会又是上次那个 CAalpha碳原子吧：） CA多不多呀？

不经意间的呐喊 发表于 2014-1-3 09:54:00

川大-灰太狼 发表于 2014-1-2 22:48 static/image/common/back.gif
不会又是上次那个 CAalpha碳原子吧：） CA多不多呀？

钙离子，越看越迷茫了。看到有人amber做，gromacs做这个文献很少。不知道怎么处理了？难道就是简单的限制一下吗

川大-灰太狼 发表于 2014-1-3 11:01:26

不经意间的呐喊 发表于 2014-1-3 09:54 static/image/common/back.gif
钙离子，越看越迷茫了。看到有人amber做，gromacs做这个文献很少。不知道怎么处理了？难道就是简单的限制 ...

请查看 gromacs的 constrain说明。
页: [1]
查看完整版本: gromacs金属离子处理