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[AutoDock&Vina] 请教如何生成配体的pdb文件

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发表于 2019-11-12 17:49:53 | 显示全部楼层 |阅读模式

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原来可以在PRODRG2 Server上生成pdb文件,现在这个服务器放在google上了,不能访问了,请教高手如何操作,感谢!
发表于 2019-11-15 09:09:07 | 显示全部楼层
pymol,还有chembio,moe,应该都可以的。
 楼主| 发表于 2019-11-15 09:48:39 | 显示全部楼层
wx_A7Xx7A9R 发表于 2019-11-15 09:09
pymol,还有chembio,moe,应该都可以的。

请教在pymol里怎样操作,谢谢指教!!
发表于 2019-11-16 10:03:53 | 显示全部楼层
河外生命 发表于 2019-11-15 09:48
请教在pymol里怎样操作,谢谢指教!!

打开PyMOL | File | open | 打开你要转换的文件
打开后 File | Export Molecule | PDB Options---Save---选择存放路径及保存为PDB格式即可。
G$[XSRBO@HYI[0XS~]4ZX}X.png
 楼主| 发表于 2019-11-18 23:44:46 | 显示全部楼层
wx_A7Xx7A9R 发表于 2019-11-16 10:03
打开PyMOL | File | open | 打开你要转换的文件
打开后 File | Export Molecule | PDB Options---Save--- ...

谢谢回复!
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