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川大-灰太狼 2017-4-19 11:07
是否是windows版本,如果是可能是autogrid的兼容性,你可以使用CMD命令进行操作,就可以避免这个问题。当然,如果是在linux下面就不会遇到这个问题。
w825936053 2017-3-22 20:44
你好,我运行autogrid的时候是一闪而过的,我想问您,这是除了什么问题
2012年9月4日 2017-3-14 20:48
您好,我在论坛上看到您的贴子,我想请求您的帮助,我用easymodeller4.0做的蛋白质同源建模,但是评分一直是六十多,我不知道该怎么才能把评分提到八十多,想请教您,谢谢,期待您的回信
xufund 2017-2-25 23:18
您好。请问您手头的pyrx0.9版本能否发给我一份吗》我的邮箱是xufund@163.com。谢谢
yahulai 2017-1-17 11:04
你好,我看到你发的http://bioms.org/forum.php?mod=viewthread&tid=888&highlight=Pymol  内容很好, 但上面的下载已经不好使了,我自己下载了试用版的,可是却用不了。希望前辈有空的时候能够给发一份。谢谢![email]2670053160@qq.com[/email]
biocai 2016-9-28 11:32
我下载了Autodock-win分子对接教程,能否把配体文件ASD.pdb文件发给我,我照着学习一下,47963490@qq.com,谢谢!
xiaoxiliu1989 2016-9-27 20:53
灰太狼您好,可以分享Schrödinger的破解软件包吗?不胜感激[email]709020170@qq.com[/email]!
kellylee 2016-9-23 23:34
灰太狼你好,请问你有没有pyrx 0.9 安装包? 谢谢
冰凝草 2016-9-8 09:56
你好,我想咨询下如果是个人需要使用YASARA的同源建模板块的话,价格收费是怎样的。你们提供这方面的服务吗?我刚接触这块,主要是想寻找到后期实验能够验证的蛋白与小分子配体结合的靶点位置,但是目前利用Easymodeller做出来的结果,UALC评分都是比较低,所以想问下,YASARA是否能够提供更为准确的一键建模的结果,可行度大概有多高,是否也需要根据具体情况进行调试,谢谢!期待您的尽快答复。
1041743697 2016-7-29 11:53
川大-灰太狼,前辈您好,感谢您能在百忙之中看到我的留言!
  小弟在用autodock软件时,一直无法生成gpf文件,导致autogrid运行时总不成功,并且总有如下的提示语, Exception in Tkinter callback
Traceback (most recent call last):
  File "D:\360Downloads\af\lib\lib-tk\Tkinter.py", line 1403, in __call__
    return self.func(*args)
  File "D:\360Downloads\af\lib\site-packages\mglutil\gui\InputForm\Tk\gui.py", line 1251, in read_cb
    f = open(newfile, 'r')
IOError: [Errno 2] No such file or directory: ''
由于小弟初学这款软件,遇到这个问题有些不知所措,所以想请您给指点下迷津!多谢多谢!
川大-灰太狼 2016-7-24 11:57
不好意思没有。
cye927 2016-7-21 10:38
你好,请问你有ModWeb的邀请码吗?能不能给我一个用一下呢,谢谢啊
cherry32333 2016-6-13 14:36
您好,我想下载Pymol1.7-win-64.zip,您发的那个链接下载不了(一直跳出来迅雷看看界面),您可以发一份给我么,不胜感激!我邮箱:cherry350982535@126.com
Alecia 2016-6-10 12:45
川大-灰太狼: 能否到论坛发个帖子:)我来回答。
您好,我已经上传了我的问题了,非常感谢您对我的帮助
Alecia 2016-6-8 16:47
你好,我想问一下我的配体是个3聚体,能用autodock进行分子对接吗?
yvonne 2016-5-9 12:36
川大-灰太狼 大神,我在windows 7-64bit系统按照说明安装easymodeller 4.0。先安装了python 2.7.11,路径:c:\python27。然后安装了modeller 9.16,路径:C:\program files\modeller 9.16,再将解压缩easymodeller 4.0_windows.rar后的两个文件放到了modeller 9.16文件目录下。然后点击右键管理员身份运行easymodeller 4.0.exe。但是无法实现正常功能,不知问题出在何处。
图片在您发的帖子—— [资源] EasyModeller2.1 3.0 4.0程序和使用手册下载 中,方便的时候请指教。
半里格 2016-4-26 11:41
大神好!使用autodock处理小分子后,由最开始的pdb保存为pdbqt格式,三氮唑环竟然开环了,请问可能是什么原因?
白天不懂夜的黑 2016-4-17 12:06
你好请问您那里有sybyl软件吗 能否分享给我一份?
hgihly 2016-3-26 16:19
您好,请问你那里还有没有怎么用3. Using APBS and PyMOL to display the electrostatics surface这个的网页版教程
川大-灰太狼 2016-3-22 21:37
请发帖说明情况,并配上图片,以便更清晰的看到。
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