Protein protein docking

mushichong · 发表于 2017-11-4 15:08:11

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schrodinger 新手
想要使用Bioluminate这一模块做蛋白质相互作用来查找和预测上下游蛋白
导入PDB文件加氢使用 protein-protein docking 供体受体模式
start docking后得到一个 out文件
文件中并没有结合能或是焦耳能量之类的可以比较蛋白相互作用程度的数据
求问有没有做这方面的大神可以帮忙答疑

风中追风 · 发表于 2017-12-2 10:05:05

蛋白选择好了之后，用protein-protein docking这个模块进行对接啊，这个过程一般花的的时间比较长。

mushichong · 发表于 2017-12-6 16:37:42

可是没有结合自由能之类的参数啊

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[Schrodinger] Protein protein docking

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