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标题: [SailVina]最终版本发布！Vina分子对接全套整合GUI [打印本页]

作者: beikwx 时间: 2020-4-11 18:10
标题: [SailVina]最终版本发布！Vina分子对接全套整合GUI
本帖最后由 beikwx 于 2020-4-14 22:17 编辑

写写停停大半年，终于把整个软件完成了！之前的版本我将在近期删除。
这是最终版本，不会再进行功能更新！
包含了分子对接需要的几乎所有工具，项目地址即详细介绍教程见：https://github.com/beikwx/SailVina[attach]2386[/attach]

word教程文档下载：
百度网盘(https://pan.baidu.com/s/19moBZp5TjZiKjDIW0R7edw) 提取码：eow2

不同版本下载地址：
1. exe版本：
百度网盘(https://pan.baidu.com/s/1Tv_FDMWryQI9iu3tEev6hg)
提取码：e4ss
2. python版本：
百度网盘(https://pan.baidu.com/s/16Sj_AtlagxwbF3fNaMST-A)
提取码：ykxb

SailVina只是一个带界面的脚本，批量调用Autodock Vina，openbabel等来便捷的进行分子对接。
可以实现以下功能：
1. 下载受体；自动准备受体。
2. 配体格式转换；根据取代基批量生成配体。
3. 验证对接方案(Protocol)是否可以还原实验结果。
4. 单个/多个配体和单个/多个受体进行对接。
5. 将对接的多个配体提取出来。
6. 提取对接的分数；批量提取分数，并选择性的提取结果。
7. 将配体和受体合并成一个文件。
8. 计算两个/多个小分子之间的RMSD值。

如果有疏漏或者错误欢迎指出。同时欢迎对项目进行再制作，本人也只是个业余喜欢编程的菜鸟，代码可能不太好看，欢迎交流讨论。

作者: beikwx 时间: 2020-4-11 18:15
这个论坛服务器不太稳定啊。贴一个软件截图

作者: 一枚高手 时间: 2020-4-13 08:56
辛苦楼主！！！

作者: 吴藥师_nDg77 时间: 2020-4-13 20:44
厉害啊~收下了

作者: biyiming23 时间: 2020-4-18 13:12
这个太省事了感觉，感谢感谢

作者: wx_k1w1kQ50 时间: 2020-4-22 16:28
果断收藏

作者: mambo 时间: 2020-4-23 08:56
支持一下！

作者: acetone 时间: 2020-4-27 16:50
整合成一个脚本太棒啦，非常感谢！

作者: 菜徐坤的蔡 时间: 2020-4-28 12:45
楼主威武

作者: guoniu35 时间: 2020-5-7 20:52
谢谢分享，很给力

作者: LxxxL 时间: 2020-7-27 20:27
厉害了想问问用过的朋友感觉咋样

作者: 罗青 时间: 2020-9-18 16:10
下载不了了呢？

作者: beikwx 时间: 2020-9-22 10:57

罗青发表于 2020-9-18 16:10
下载不了了呢？

网盘都能下，也可以去项目地址查看。

作者: liushukai 时间: 2020-9-22 13:54
非常有价值的工作

作者: Jheng_zyp0X 时间: 2020-9-28 15:40
太厉害了，简直想给你发红包

作者: guan 时间: 2020-10-3 10:44
为什么配体准备出来不对，奇形怪状的。

作者: beikwx 时间: 2020-10-4 20:41

guan 发表于 2020-10-3 10:44
为什么配体准备出来不对，奇形怪状的。

请确认原始配体的文件格式、结构是否正确。

作者: 小绳结 时间: 2020-12-15 09:54
学习了，辛苦楼主了！

作者: InternetX 时间: 2021-4-7 12:28
谢谢看看是否可行

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