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[提问] 求助,如何将amber16的mdcrd转换成VMD识别的格式,谢谢 新人帖 New yuanlinchen 昨天 17:20 06 yuanlinchen 昨天 17:20
[提问] sander.MPI并行运算速度慢 半里格 2017-11-18 474 viger87 4 天前
[原创] 转录因子模拟能发多少分的文章? 历史的留言 2014-6-23 1702 yuanlinchen 2017-12-1 09:13
[提问] 使用AutoDock VS进行对接时保存结果时出错 attach_img 孟依然 2017-11-17 042 孟依然 2017-11-17 16:20
[提问] 急急急!求Zn2+模拟所需的参数文件,包括frcmod以及prepi 新人帖 Nidane_i66PC 2017-10-27 0102 Nidane_i66PC 2017-10-27 20:14
[提问] 带金属Ni2+离子的酶如何跑动力学 yuyanqing 2014-11-6 7942 Nidane_i66PC 2017-10-27 20:08
[提问] Amber是否能用于计算配体中的基团与蛋白之间的能量? gct 2017-9-28 1186 邙山的鱼 2017-10-9 14:08
[原创] 用amber中的MMPBSA算二聚体结合能的问题 attach_img - [回帖奖励 10 ] 疯狂的鬼马 2017-9-18 1212 syjohn 2017-9-27 00:24
[原创] AMBER12拟合小分子resp电荷 agree 墨竹晓风 2013-1-10 33130 威夫 2017-9-3 15:55
[提问] amber 倒入蛋白PDB生成参数时提示出错 新人帖 davide1988 2016-3-19 2504 威夫 2017-9-3 15:52
[提问] amber软件的模拟步骤 新人帖 纸风车 2017-8-28 1274 syjohn 2017-8-29 02:46
[提问] Amber不识别CL Created a new atom named: CL1 半里格 2017-7-22 5171 邙山的鱼 2017-8-11 21:47
[原创] 分子动力学模拟计算求助 离去无期 2017-6-13 1287 a11520850 2017-7-19 16:40
[提问] 求助native interactions和nonnative interactions分别指什么? 新人帖 abiana 2017-7-4 0132 abiana 2017-7-4 09:37
[提问] 小白求助:amber怎么做二级结构随时间变化的图 窗边的小豆豆 2016-12-8 2259 邙山的鱼 2017-6-30 16:25
[提问] amber计算蛋白与小分子动力学出错 a779521025 2017-6-21 2272 邙山的鱼 2017-6-30 16:22
[提问] 二聚体MD之后rmsd异常,可能是显示了镜像,怎么还原回正常 attach_img 疯狂的鬼马 2017-6-6 0150 疯狂的鬼马 2017-6-6 09:39
[提问] 纤维素长链或者晶体结构拓扑文件获得问题 新人帖 苏玖染 2017-5-24 0134 苏玖染 2017-5-24 11:06
[原创] 如何计算二级结构随模拟时间的变化及各成分的比例 优秀 digest agree Babyblue 2012-10-24 61878 j加速度123 2017-5-23 17:14
[提问] 小分子配体-蛋白-膜体系的结合自由能计算 wangpanpan98 2017-5-3 1324 puzhongji 2017-5-8 13:25
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