double 发表于 2013-11-21 15:04:08

leos 发表于 2013-11-20 17:52 static/image/common/back.gif
力场错误~~,明显的

leos大哥,我是分子模拟的菜鸟加新手,麻烦问一下如果是力场错误在哪里能看出错误来并纠正呢?

double 发表于 2013-11-25 11:25:23

谢谢各位大侠的帮助,问题已经解决了,是参数中二面角的问题。我把二面角全部都确认了一边,把没有的补上,就可以了。原先没改的时候,跑程序是自动选择了错误的二面角,所以才导致了键角的畸形。

南华-ET 发表于 2014-12-1 09:38:03

double 发表于 2013-11-25 11:25
谢谢各位大侠的帮助,问题已经解决了,是参数中二面角的问题。我把二面角全部都确认了一边,把没有的补上, ...

你好,我也遇到了这个问题,但是我没看明白你的解决方法,在那修改二面角,pdb文件里吗?
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查看完整版本: 请教各位大虾分子模拟平衡过程中遇到的一个问题