南华-ET 发表于 2013-9-2 21:29:03

gromacs pdb2gmx 出错

安装好gromacs后我按照中文指南里的步骤开始跑，结果到一步就出问题了，我输入的命令是：
pdb2gmx –ignh –ff G43a1 –f 1OMB.pdb –o fws.pdb –p fws.top –water spce

结果提示：Program pdb2gmx, VERSION 4.5.5
Source code file: /build/buildd/gromacs-4.5.5/src/gmxlib/statutil.c, line: 819

Invalid command line argument:
–ignh
For more information and tips for troubleshooting, please check the GROMACS
website at http://www.gromacs.org/Documentation/Errors
到底是什么原因呢？

海洋 发表于 2013-9-4 08:28:50

不知道楼主当时是否是直接从pdf上复制的，可能是字母输入法非英语格式导致，不放试一下自己手动敲入一下！
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