margaretli 发表于 2013-7-14 21:30:19

autodock在autogrid时出现错误,望大神帮帮忙~!

刚开始学习autodock,我的系统是win7,64位旗舰版,MGLtools-1.5.6版,autodock4.2.3。在运行到autogrid时出现图中的错误希望大神帮帮忙

川大-灰太狼 发表于 2013-7-15 10:45:37

估计是你设定的可旋转的柔性残基过多!如果你只是新手要学习Autodock,请不要去设定柔性残基,柔性残基的计算非常好耗时,且结果目前看来不如非柔性残基的对接准确。以下是同类问题的讨论!
http://mgl.scripps.edu/forum/viewtopic.php?f=9&t=1309
其次,建议大家最好在linux系统下面使用Autodock。

margaretli 发表于 2013-7-15 16:46:36

非常感谢您的回复,因为之前没用过这个软件,所以我这个是用官网上的hsg和ind那两个来练习的,操作也是按照教程来的。那我把教程上柔性残基设置那步省略试试??
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