liangjun 发表于 2013-7-12 15:36:43

关于gpu的gromacs-4.6的安装求助

最近尝试了一下安装gromacs4.6版本，但到了make阶段出现了错误，进行不下去了，也不知道怎么解决，不知道哪位童鞋能够帮忙看一下，谢谢~~
我是有安装gpu的，在cmake阶段gpu=on，也没报错。安装的cuda是5.0的，尝试过验证安装，也应该没问题，不知道怎么处理了……

Completed 'gmxfftw'
Built target gmxfftw
Building NVCC (Device) object src/gmxlib/gpu_utils/CMakeFiles/gpu_utils.dir//./gpu_utils_generated_gpu_utils.cu.o
In file included from /usr/local/cuda/include/cuda_runtime.h:59:0,
                  from <command-line>:0:
/usr/local/cuda/include/host_config.h:82:2: error: #error -- unsupported GNU version! gcc 4.7 and up are not supported!
CMake Error at gpu_utils_generated_gpu_utils.cu.o.cmake:198 (message):
   Error generating
   /home/dell/gromacs-4.6.3/build/src/gmxlib/gpu_utils/CMakeFiles/gpu_utils.dir//./gpu_utils_generated_gpu_utils.cu.o


make: *** Error 1
make: *** Error 2
make: *** Error 2

liangjun 发表于 2013-7-13 14:03:37

自己回答一下吧
现在发现是编译器的问题，cuda5.0并不支持gcc4.7或以上版本的编译器，so，现在尝试把编译器的版本降低一下，看能不能装成功

南华-ET 发表于 2013-7-27 16:28:17

我用gcc++就好像没有出现这样样的问题

liangjun 发表于 2013-7-28 09:16:53

南华-ET 发表于 2013-7-27 16:28 static/image/common/back.gif
我用gcc++就好像没有出现这样样的问题

是我孤陋寡闻吗，有gcc，也有g++，貌似没有gcc++的编译器吧……

南华-ET 发表于 2013-8-2 16:52:06

liangjun 发表于 2013-7-28 09:16 static/image/common/back.gif
是我孤陋寡闻吗，有gcc，也有g++，貌似没有gcc++的编译器吧……

确切的说是gcc-c++，网上有这个的安装提问的，现在我出现了你这个问题gmxfftw没法安装，你解决了吗？

liangjun 发表于 2013-8-4 16:07:00

南华-ET 发表于 2013-8-2 16:52 static/image/common/back.gif
确切的说是gcc-c++，网上有这个的安装提问的，现在我出现了你这个问题gmxfftw没法安装，你解决了吗？ ...

那你写清楚啊……
你出现哪个问题了……

eming 发表于 2013-8-6 20:56:16

我是CUDA4.0
没有错误

liangjun 发表于 2013-8-7 08:28:42

本帖最后由 liangjun 于 2013-8-7 08:36 编辑

eming 发表于 2013-8-6 20:56 static/image/common/back.gif
我是CUDA4.0
没有错误
我是5.0的，现在也可以装，其实只要是cuda的版本大于2.0的都可以，编译器符合要求，安装好需要的包就好了……
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