黎溪 发表于 2013-5-17 11:25:45

Discovery Studio ZDOCK

想用Discovery Studio的进行分子对接，receptor是同源建模而得到的，ligand是从RCSB Protein Data Bank - RCSB PDB中下载的，进行分子对接时，需要对上述两个pdb文件进行怎样的处理？ ZDOCK结果能出来，但进行RDOCK是总是出不来结果，提示error。我是一步一步按照教程做的，做了3遍，仍然出现同样的错误，急需各位给点建议。谢谢！！

znjnancy 发表于 2015-1-4 20:54:02

ZDOCK之前recepor和ligand都需要进行clean protein处理，查看clean protein report

iovvoi 发表于 2015-1-14 15:22:08

RDOCK加力场CHARMm Polar H
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