susi 发表于 2020-8-10 20:15:50

融合蛋白建模

求助前辈们 问题如下：
现在做融合蛋白（A-linker-B-linkerC）建模用modeller ，官网上对于融合蛋白就说了一句，对齐比对文件。查看相应文献，发现，要用modeller进行融合蛋白建模，需要分别将融合蛋白的A、B以及C链分别与其相应的模板进行比对，然后手动对齐，请问应该如何手动对齐呢？已经尝试了将比对的文件ali pap进行copy到一个文档，这个不可行。
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