多斯 发表于 2019-9-20 16:49:27

ledock相同条件 结果不同

老师您好,就是我使用ledock做对接时,相同条件下所产生的结果不同。我觉得ledock以模拟退火和遗传算法交叉应该也有重现性哟。 我现在做的是为了检验对接的有效性,之后做药物改构要做对接, 现在的对接结果我不知道选什么参数来做之后的对接。刚接触对接,用过ds autodock 做了,RMSD大于2,就现在做ledock有RMSD小于2的,想问问老师我下一步怎么做?

liushukai 发表于 2019-9-26 10:12:14

直接放了原始结果……起码多点分析吧……比如希望的结合模式什么的。也不知道有问题的结果是什么……
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