mushichong 发表于 2017-11-4 15:08:11

Protein protein docking

schrodinger 新手
想要使用Bioluminate这一模块做蛋白质相互作用来查找和预测上下游蛋白
导入PDB文件 加氢 使用 protein-protein docking 供体受体模式
start docking后 得到一个 out文件
文件中并没有结合能 或是焦耳能量之类的可以比较蛋白相互作用程度的数据
求问有没有做这方面的大神可以帮忙答疑

风中追风 发表于 2017-12-2 10:05:05

蛋白选择好了之后，用protein-protein docking这个模块进行对接啊，这个过程一般花的的时间比较长。

mushichong 发表于 2017-12-6 16:37:42

可是没有结合自由能之类的参数啊
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