疯狂的鬼马 发表于 2017-4-21 15:03:31

求助! amber16用于跑aMD加速动力学时出现cudaMemcpy GPUBuff

用amber16跑蛋白质的加速动力学，但是cuda加速在跑aMD的时候，出现CudaMemcpy GpuBuffer: Download failed an illegal memory access was ecountered.的报错这是为什么啊？
我输入的aMD的命令：pmed.cuda -O -i amd.in -o amd.out -p a.prmtop -c eq.rst -r amd.rst -x amd.nc 是命令错了吗？
图片是我的报错和in文件
求助大神呀

WLQ 发表于 2017-4-28 17:13:36

GPU是什么型号呢

puzhongji 发表于 2017-5-3 09:42:38

一般是由于结构不合理，空间临近导致的某个原子速度过大

疯狂的鬼马 发表于 2017-5-5 20:37:05

WLQ 发表于 2017-4-28 17:13
GPU是什么型号呢

用的是1080Ti,我在网上查的是因为GPU的原因，

疯狂的鬼马 发表于 2017-5-5 20:38:16

puzhongji 发表于 2017-5-3 09:42
一般是由于结构不合理，空间临近导致的某个原子速度过大

我最后修改了加速参数就可以了，那这种结构不合理是加速参数设置不合理的原因吗？
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