wgmgdt 发表于 2016-12-23 15:45:59

opls力场

我自己做的分子力场,用pdb2gmx这个命令没问题可以生成想要的文件,但是再进行下一步给体系加离子的时候报错没有默认的键类型和默认的角类型?不知道哪个环节出现了问题,请各位大神解决!我修改了氨基酸的rtp和dat文件。

wangpengfei 发表于 2016-12-24 19:27:55

仿着其他力场文件夹里的文件一一补齐,如果有特殊氨基酸还需在总的氨基酸type里注明。
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