用pymol做align时出现错误
用pymol做align时出现错误,如下图,求助论坛大神帮忙~谢谢首先,你是做 什么的叠合?是小分子还是蛋白质?其次,你的操作过程是如何的?到哪一步报错的。 川大-灰太狼 发表于 2016-9-6 22:15
首先,你是做 什么的叠合?是小分子还是蛋白质?其次,你的操作过程是如何的?到哪一步报错的。 ...
蛋白质与蛋白质,操作过程就是打开两个蛋白质的PDB结构(PDB:4bsw,2wah)后,选择align-to molecule,之后就出现错误,但是其他蛋白质结构align没有问题。 哈尼月月 发表于 2016-9-8 13:13
蛋白质与蛋白质,操作过程就是打开两个蛋白质的PDB结构(PDB:4bsw,2wah)后,选择align-to molecule,之 ...
是你的蛋白文件有问题,从蛋白质库中下载的不是标准的蛋白文件,可以使用yasara,LeadIT,DS,maestro,pymol等工具软件重新另存一下该文件为pdb,就可以了。
谢谢你的帮忙,原来这样~
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