时光过客 发表于 2016-7-25 09:51:39

新手求赐教

用autodock对后，保存复合物的pdb文件，用Ligplot打开，结果不一样是怎么回事？？？比如在autodock分析相互作用时有氢键，在ligplot中就没有氢键？？？

wangpengfei 发表于 2016-7-25 11:08:40

各个软件对氢键，相互作用的定义和算法不同。你再用别的试也还是一样的。

时光过客 发表于 2016-7-25 12:07:05

wangpengfei 发表于 2016-7-25 11:08
各个软件对氢键，相互作用的定义和算法不同。你再用别的试也还是一样的。 ...

所以这是正常的现象？？不用解决呗？？？？

wangpengfei 发表于 2016-7-25 12:34:41

没法解决。不信你用ds，薛定谔，sybyl，moe，adt，dock，pymol分别打开看看，肯定有出入，甚至同一软件不同版本都不一样。所以也毋需解决。

时光过客 发表于 2016-7-25 15:27:27

明白了，，谢谢指教

时光过客 发表于 2016-7-25 15:27:59

wangpengfei 发表于 2016-7-25 12:34
没法解决。不信你用ds，薛定谔，sybyl，moe，adt，dock，pymol分别打开看看，肯定有出入，甚至同一软件不同 ...

明白了，，谢谢指教
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