大工-阿里巴巴 发表于 2012-11-23 18:45:44

PyMOL中的APBS插件具体使用方法简介

PyMOL中的APBS插件具体使用方法简介,在之前发布了一个关于APBS插件的简介,一直答应老张哥写个简单的教程,今天终于写好了~请大家批评指正!
APBS是计算蛋白静电势的一个优秀的程序,配合pymol显示蛋白的静电表面,有助于辅助分析蛋白在不同pH下的稳定性与活性,以及特定区域的电势变化情况。

猪猪侠爱科学 发表于 2016-9-2 21:45:10

你好,在pymol自带的action-generate-vaccum elec...中也可以得到蛋白表面电势,这个用的也是apbs,你觉得两种方法有区别吗

潇子涵 发表于 2015-1-4 23:15:55

阿里兄,想请教你我的pymol一作APBS就程序报错。能不能提供一下可用的软件试试看,谢谢!我是新手,请多指教。

xjzhu 发表于 2016-7-7 13:26:57

谢谢啊,东西很好

jerrysky2011 发表于 2012-11-23 18:58:44

:)很好的东西,感谢提供!~!!!!!

海洋 发表于 2012-11-23 19:11:47

谢谢啊,学习ing

墨竹晓风 发表于 2012-11-23 19:12:19

哇呀,等了很久。谢谢

cnDenis 发表于 2012-11-23 20:25:01

感谢阿里兄!pymol做出来的图就是漂亮啊

墨竹晓风 发表于 2012-11-24 12:09:46

我手头的两台电脑测试下来,需要用pymol 0.99或者1.1 版本,用1.5版本会内存错误。Windows7和xp均可以。谢谢巴巴指导

川大-灰太狼 发表于 2012-11-25 14:30:42

呵呵 好东西!谢谢 阿里分享!

浙农林—老张 发表于 2012-11-27 10:57:43

辛苦了,阿里。

cuiyoutian 发表于 2012-12-1 20:24:13

这个真好。。我也用作固定化酶试试。哈哈

大工-阿里巴巴 发表于 2012-12-2 10:57:32

cuiyoutian 发表于 2012-12-1 20:24 static/image/common/back.gif
这个真好。。我也用作固定化酶试试。哈哈

恬同学有问题互相交流哈~
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