关于CaDA模型用来模拟ZN蛋白的问题？
请教各位，关于Zinc Protein Simulations Using the Cationic Dummy Atom (CaDA) Approach，按照官网的说明将各个文件已经放到amber中了，但是不知道怎么构建模拟体系？不明白original_zinc.pdb
revised_zinc.pdb
这两个文件怎么使用？有哪位大神用过这个方法，还请指教一下，感激不尽！
CaDA模型官网：
http://www.mayo.edu/research/labs/computer-aided-molecular-design/projects/zinc-protein-simulations-using-cationic-dummy-atom-cada-approach
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