wangmoye1991 发表于 2015-9-24 14:47:27

amber软件能计算蛋白质的Q值吗？

请问大家，amber中的mdcrd轨迹能不能直接算Q值？或者天然态接触数？另外还有一个问题，mdcrd轨迹文件是按照原子坐标写出的，我有一条完整的mdcrd轨迹，在amber中能不能直接得到去除氢原子的轨迹？谢谢各位~~~
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