DS visualizer 分析vina 对接结果的补充
之前论坛有同仁介绍用DS visualizer 分析vina 对接结果，很方便，也很实用。但是用DS 来分析vina的分析结果时，由于vina对接结果文件格式为pdbqt，在DS中显示时会出错，比如，氯原子永远以甲基形式显示，这无疑对结果的分析和化合物的选择造成一定的不便和假象，经过我自己的摸索，找到了解决方法，跟大家分享一下，很简单！只需要安装一个很棒的文件格式转换软件 openbabel，将vina对接结果的pdbqt文件转换成pdb格式的文件，再在DS里显示就不会出错了。openbabel 免费下载地址http://openbabel.org/wiki/Get_Open_Babel。又可以多一种方法啦哈哈！
用pymol可以打开pdbqt。
页:
[1]