puzhongji 发表于 2015-5-12 19:43:47

问2个对接的问题

1.看到有的文献中800 separate docking runs,这个处理应该有自动处理的脚本吧，这个怎么实现呢？
2.在不同pH下protonation state，这个怎么实现呢？

川大-灰太狼 发表于 2015-5-13 17:17:33

1、有命令脚本可以实现，我们qq群里不是有朋友共享了吗：）2、使用YASARA可以在不同PH值给予氨基酸不同的质子化状态！

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