史小史 发表于 2015-5-11 09:26:14

用NAMD-ABF的方法算自由能 怎样分析得出的结果？

之前问过一师兄ABF方法算出的pmf值是不是就是体系自由能值？看了手册里面说这个pmf文件指integrated free energy profile or
PMF不知道是不是就是指自由能的变化？ 他说是的 不过要校正体积元的变化
话说这个体积元的变化怎么校正？

史小史 发表于 2015-5-12 14:13:17

不知道这个pmf跟自由能间有啥关系 俺老师说可能要积分
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