璐璐 发表于 2015-1-14 10:26:25

amber能否加外加电场

看的文献中提到通过外加电场来研究蛋白质的一些性质和与配体结合的结合能，谁知道amber能否加外加电场呢。文献中看到有用NAMD做的，只是没有具体提到操作步骤，手册上也没找到明确的说明。大家有经验的可以给点儿建议，谢谢了{:soso_e121:}

璐璐 发表于 2015-1-14 10:58:35

另外加外加电场的话的还有方向的确定，电场单位一般都是 V/nm，还有跟偶极矩联系在一起，单独加在溶剂上的
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