coolben 发表于 2014-12-27 15:02:38

amber分子动力学模拟 Tyr的质子化如何设置

{:soso_e100:}小弟最近用amber做酶和底物的分子动力学模拟MD ，但是活性位点上有个Tyr，这个残基的酚羟基的去质子化可能是酶活性状态所必须的，请问哪位前辈如何设置 Tyr去质子化？拜谢！
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