中科院-石头 发表于 2012-10-27 10:56:54

求解Ki,Kd和Km的区别

这几个参数,在表征酶抑制剂结合能力的时候经常出现,看了一些相关公式后,还是不能有个感性的认识,希望谁能解释下。我接触过的有Kd值,反映了抑制剂与酶的结合解离能力,值越小,结合能力越强。

川大-灰太狼 发表于 2012-10-27 12:48:27

Ki   抑制常数Kd解离常数Ki=KdKm   米氏常数KD   平衡解离常数先来看动力学(Kinetics)与亲和力(Affinity)的区别:动力学可以告诉我们的信息:1、反应发生的速度 – Time-dependent;2、结合速率 (Ka)– how fast molecules bind;3、解离速度(Kd)– how fast complexes fall apart;4、动力学性质决定在给定的时间内复合物是否能够结合或者解离。亲和力可以告诉我们的信息:
1、复合物结合的强度 – Time-independent2、亲和力决定在平衡状态下形成了多少复合物(平衡态时结合速率等于解离速率)。对于 A+B=AB的反应(必须给定反应方程式)解离常数kd与平衡解离常数KD的区别。
解离常数Kd不可能大于1, Kd的单位是S-1;Kd表示单位时间内解离了的AB(即AB)占解离前初始AB的比例,由此可见Kd能表示解离反应的快慢,Kd越大代表解离越快,Kd越小代表解离越慢;平衡解离常数KD=Kd/Ki,KD单位是M(mol/L);KD=/,KD可以表示出处于平衡状态时AB的解离程度,KD越大说明解离越多,代表AB之间亲和力越弱,KD越小说明解离越少,代表AB间亲和力越强;根据KD,可以计算出AB发生解离的比例(百分比),反之亦可推导。如:解离百分比为20%,则KD=0.2*0.2/(1-0.2)=0.05(M);再如KD=10-6 M,则解离百分比约为0.1% 。米氏方程(Michaelis-Menten Equation)或米曼氏动力学(Michaelis-Menten kinetics)是由Leonor Michaelis和Maud Menten在1913年提出,是酶学中极为重要的可以描述多种非变异构酶动力学现象、表示一个酶促反应的起始速度V(有些资料中也称为Vo)与底物浓度关系的速度方的方程,米氏方程形式如下:
static/image/common/none.gif
2012-10-27 12:35 上传下载附件 (790 Bytes)其中,Vmax表示酶被底物饱和时的反应速度,Km值称为米氏常数,是酶促反应速度V为最大酶促反应速度值一半时的底物浓度。在酶促反应中,底物情况在低浓度下,反应相对于底物是一级反应(first order reaction);而当底物浓度处于中间范围时,反应(相对于底物)是混合级反应(mixed order reaction);当底物浓度增加时,反应由一级反应向零级反应(zero order reaction)过渡;当底物浓度逐渐增大时,速度V相对于的曲线为一双曲线。下图为米氏方程的模拟作图:
static/image/common/none.gif
2012-10-27 21:09 上传下载附件 (42.96 KB).参考:http://chemwiki.ucdavis.edu/Biological_Chemistry/Catalysts/Enzymatic_Kinetics/Enzyme_Inhibition

中科院-石头 发表于 2012-10-27 22:17:47

解释的真是透彻,多谢了

seagoing 发表于 2012-10-28 15:01:07

这个ki应该是离解常数,不是结合常数。

seagoing 发表于 2012-10-28 15:02:12

autodock中算出来的ki,从化学角度来说应该属于离解常数的。
页: [1]
查看完整版本: 求解Ki,Kd和Km的区别