中国心 发表于 2012-11-2 10:14:15

各位大侠，sybyl能不能blind docking？

各位大侠好，想请教一下sybyl中有没有类似于autodock中的blind docking那种模块呢？

川大-灰太狼 发表于 2012-11-2 11:29:28

是的，不能！但是sybyl有模块可以做活性位点的预测，并进行多活性位点对接，功能与autodock的相似。

浙农林—老张 发表于 2012-11-2 13:01:07

可以。有自动识别和对接的。

大工大-Chemoinf 发表于 2012-11-2 16:54:16

sybyl中surflex-dock有自动找活性中心的，然后进行对接。当然最好要验证对接的合理性。比如通过文献的报道等。

中国心 发表于 2012-11-2 22:38:56

大工大-Chemoinf 发表于 2012-11-2 16:54 static/image/common/back.gif
sybyl中surflex-dock有自动找活性中心的，然后进行对接。当然最好要验证对接的合理性。比如通过文献的报道 ...

Thank you～

中国心 发表于 2012-11-17 16:10:27

川大-灰太狼 发表于 2012-11-2 11:29 static/image/common/back.gif
是的，不能！但是sybyl有模块可以做活性位点的预测，并进行多活性位点对接，功能与autodock的相似。 ...

学习了，你说的是不是surflex-dock？一般sybyl都是用surflex-dock吧？我就会那一种对接，还是sybyl做分子对接就是surflex-dock对接方法？

中国心 发表于 2012-11-17 16:11:54

浙农林—老张 发表于 2012-11-2 13:01 static/image/common/back.gif
可以。有自动识别和对接的。

那是哪个模块呢？请指教
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