longdlut 发表于 2014-6-18 21:13:04

Autodock和ligplus联用作图相关问题？

Autodock对接结果之后，通过保存成pdb文件之后，用ligplus分析，经常出现如下问题：
1：配体结构不完整，
2：或者作用区域范围的氨基酸仅有几个
如图所示，是保存的pdb文件有问题呢？还是ligplus参数设置的问题呢？
2.png(15.05KB)

jianchen7882 发表于 2014-6-20 07:58:16

应该是对接的事情吧，ligplus参数默认设置时一般没事

不经意间的呐喊 发表于 2014-6-26 21:29:32

应该是pdb文本的事情。修改一下即可

longdlut 发表于 2014-7-8 19:32:42

不经意间的呐喊 发表于 2014-6-26 21:29 static/image/common/back.gif
应该是pdb文本的事情。修改一下即可

怎么修改呢？怎么解决

不经意间的呐喊 发表于 2014-9-14 18:19:48

参考这个帖子

不经意间的呐喊 发表于 2014-9-14 18:20:05

不经意间的呐喊 发表于 2014-9-14 18:19
参考这个帖子

http://bioms.org/forum.php?mod=viewthread&tid=608&highlight=ligplus
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