临江仙 发表于 2014-5-24 15:54:59

YASARA动力学模拟RDF分析

本帖最后由 临江仙 于 2014-5-24 16:02 编辑

   条件：1，首先已经完成MD模拟
                2，标准RECILES一份，并进行修改，如附图。
                3，play macro file 即可，在目标文件夹便会产生RDF的sce文件和tab文件。
                4，以YASARA打开sce文件，即可查看。

zeugmato 发表于 2014-12-12 02:02:03

本帖最后由 zeugmato 于 2014-12-12 02:10 编辑

我的生成了视图，但是目标文件夹里没有RDF的sce文件和tab文件，是怎么回事？而且这个视图没有坐标，怎么定量分析水分子的分布啊……

zeugmato 发表于 2014-12-12 17:00:57

zeugmato 发表于 2014-12-12 02:02
我的生成了视图，但是目标文件夹里没有RDF的sce文件和tab文件，是怎么回事？而且这个视图没有坐标，怎么定 ...

问题已解决，是在md_analyze.mcr这个宏里修改参数，不用自己新建一个专门计算rdf的宏
谢谢大仙学长！

麦客 发表于 2016-11-24 21:16:49

请问出现这种情况是啥意思？

麦客 发表于 2016-11-24 21:17:58

hammer159 发表于 2017-3-16 10:17:44

不太懂新手，求教怎么样状态是动力学模拟结束，然后出来数据
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