puzhongji 发表于 2014-3-17 16:46:49

酶定点突变后,结构影响功能

如何确定酶的活性位点?如何选择相关活性位点,进行氨基酸突变,突变为那个氨基酸,选择思路是?突变后如何确定突变酶活性?整个过程用生物信息,分子模拟的思路大概分析解决,不涉及实验,求教各位这样普遍问题的一般解决思路是什么?

墨竹晓风 发表于 2014-3-18 09:59:51

只做分子模拟来解释有点困难。我的初步设想是通过突变不同的残基,然后计算底物与蛋白的结合自由能,并查看形成的氢键的变化规律,如果某个残基被突变后,氢键减少,能量降低,说明这个残基有比较重要的作用。但是,突变后确定突变酶活性,这个应该办不到吧。

多斯 发表于 2020-6-21 16:31:27

墨竹晓风 发表于 2014-3-18 09:59
只做分子模拟来解释有点困难。我的初步设想是通过突变不同的残基,然后计算底物与蛋白的结合自由能,并查看 ...

以实验文章为基础,通过计算来解释酶的活性改变的原因是否可行?
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